Институт отоларингологии им. проф. А.И. Коломийченко организован Приказом Министра здравоохранения УССР № 420 от 5 июля 1960 во исполнение постановления Совета Министров УССР от 7 июня 1960 с целью разработки научных проблем по предупреждению и снижению заболеваемости населения болезнями уха, горла и носа, предоставления практической помощи оториноларингологическим заведениям и подготовки кадров квалифицированных врачей-оториноларингологов.

Инициатором и учредителем Института был доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой оториноларингологии Киевского института усовершенствования врачей Алексей Исидорович Коломийченко (1898-1974 гг.) - талантливый ученый, прекрасный организатор, мудрый руководитель, который и был назначен первым директором Института.

За личные заслуги перед страной и наукой А.И. Коломийченко был удостоен высшего из возможных тогда для ученого звания - лауреата Ленинской премии - за разработку и широкое внедрение методов восстановления слуха при отосклерозе. Алексей Исидорович был избран членом-корреспондентом Академии наук Украины.

В 1974 А.И. Коломийченко передал руководство институтом своему ближайшему ученику и преемнику профессору А.И. Цыганову.

Алексей Иванович Цыганов - доктор медицинских наук, профессор, лауреат Государственной премии УССР. С 1974 до 1985 гг. - директор Киевского научно-исследовательского института отоларингологии.

Основные направления научно-практической деятельности А.И. Цыганова: диагностика и терапия опухолей и воспалительных заболеваний уха, горла, носа. Разработал новые способы ранней диагностики, консервативного и оперативного лечения больных с опухолями уха, горла, носа с использованием рентгенотерапии и глубокого охлаждения.

За внедрение криохирургии в клиническую практику в 1977 ему была присуждена Государственная премия УССР.

С 1985 г. Институт возглавляет доктор медицинских наук, профессор, академик НАМН Украины, Заслуженный деятель науки и техники Украины, Лауреат Государственной премии Украины в области науки и техники Дмитрий Ильич Заболотный.

Основные направления научной деятельности Д.И. Заболотного связаны с проблемами оториноларингологии, иммунологии, аллергологии, онкологии. Д.И. Заболотный является инициатором, координатором и одним из ведущих авторов разработки и внедрения в Украине самой передовой в мире технологии кохлеарной имплантации для реабилитации больных с глухотой, новых методов эндоскопической хирургии на ЛОР-органах, усовершенствования и внедрения сложных краниофациальных хирургических вмешательств у больных с ЛОР-онкопатологией и патологией основания черепа.

Благодаря неустанному труду профессора А.И. Коломийченко, умелому подбору кадров, многогранным знаниям и глубокой эрудиции уже в первое десятилетие Институт вышел на передовые позиции мировой науки.

А.И. Коломийченко создал школу выдающихся ученых и высококвалифицированных отоларингологов. Среди них - профессора и доктора медицинских наук В.Г. Базаров, К.М. Веремеенко, В.А. Горчаков, Ю.М. Гузеев, В.А. Гукович, А.А. Гюльхасян, А.А. Евдощенко, Л.А. Зарицкий, И.А. Курилин, С.И. Мостовой, А.К. Покотиленко, Л.Г. Розен-фельд, А.И. Раскладка, Ю.А. Сушко, Г.Э. Темен, В.А. Тринос, А.П. Федотов, А.И. Цыганов, Т.В. Шидловская, И.А. Яшан и др.

Большинство из них, продолжая дело своего учителя, стали руководителями кафедр медицинских вузов и учреждений последипломного образования, а также лабораторий и отделов института.

А.И. Коломийченко подчеркивал необходимость создания комплексного учреждения, где сочетались бы лечебная, научная, учебная и практическая деятельность. Он считал, что это будет способствовать повышению качества результатов исследований, объединению ученых и врачей для решения важнейших проблем.

Научные интересы Алексея Исидоровича были разносторонними - они выходили за рамки специальности. Кроме значительных достижений в области клинической отоларингологии, он внес значительный вклад в разработку тонзиллярной проблемы, диагностику и лечение воспалительных процессов в среднем ухе, внутричерепных осложнений, в консервативную терапию пациентов при основных заболеваниях уха, горла и носа, в лечении лиц с травматическими повреждениями, склеромой верхних дыхательных путей, профессиональной патологией органа слуха, в диагностику и лечение тугоухости различного генеза, был хорошо знаком с новейшими достижениями биологии, биохимии, физики, кибернетики. С самого начала организации института Алексеем Исидоровичем было предусмотрено создание, наряду с клиническими подразделениями, теоретических лабораторий - биохимии, патофизиологии, микробиологии, патоморфологии, гистологии. Уделялось много внимания изучению биохимии при отосклерозе, в частности, выяснению роли гормонов, витаминов, микроэлементов в патогенезе этого заболевания. Исследовалась роль половых гормонов, гормонов коры надпочечников, никотиновой кислоты, различных медиаторов в развитии отосклероза, что стало предпосылкой использования ряда биоактивных веществ для консервативного лечения больных. Кроме того, в этот период изучалась также роль гормонов коры надпочечников, микроэлементов, витаминов и сывороточных белков у больных раком гортани.

В лаборатории биохимии впервые в стране были получены препараты кристаллического трипсина и альфа-химотрипсина, которые нашли широкое применение не только в оториноларингологии, но и в других областях медицины - хирургии, стоматологии, офтальмологии, ортопедии и травматологии. Ферментные препараты оказались эффективными при слухоулучшающих операциях, гайморитах, адгезивных и гнойных отитах, а также при лечении послеоперационных ран.

За разработку теоретических основ медицинской энзимологии и принципов применения этих методов в клиническую практику зав. отдела биохимии проф. К.М. Веремеенко и зав. отдела онкологии проф. Г.А. Опанащенко была присуждена Государственная премия Украинской ССР за 1987 г.

По инициативе и при непосредственном участии Алексея Исидоровича разработан и широко внедрен в практику метод ультразвуковой терапии, создана специальная аппаратура; изучалось влияние низких температур и лазерного луча на живые ткани, а затем (после клинической апробации сконструированной аппаратуры) эти методы с успехом применялись при лечении пациентов с различными оториноларингологическим заболеваниями.

В 1983-1990 гг. в Институте проведены пионерские работы по повышению эффективности лучевой терапии путем использования радиомодифицирующих факторов: локальной электромагнитной гипертермии, искусственной кратковременной гипергликемии, лекарственных средств, внутривенного облучения крови. Впервые в Украине для диагностики заболеваний ЛОР-органов применено термографию.

Многочисленные специалисты отдела онкологии, врачи высочайшей квалификации во главе со своим руководителем Г..А. Опанащенко в дальнейшем успешно продолжили совершенствование и широкое внедрение методов хирургического и комбинированного лечения онкологических заболеваний верхних дыхательных путей, пластических ЛОР-онкологических операций. В 1995 учеными отделения впервые в Украине было выполнено краниофациальное вмешательство при опухолях носа и околоносовых пазух, которое в дальнейшем вошло в практическую деятельность онко-хирургов Киева.

В отделении рентгенорадиологии под руководством чл.-корр. НАН Украины, академика НАМН Л.Г. Розенфельда были успешно освоены технологии интраскопии на основе применения электрорентгенографии, двойной электронно-ядерной спектроскопии и томографии, дистанционной инфракрасной термографииї.

В научно-практическом Центре фониатрии под руководством В.А. Триноса были внедрены методики по восстановлению функциональных нарушенного голосового аппарата путем вокальной и речевой фонопедии.

Отдел воспалительных заболеваний ЛОР-органов был и остается базовым подразделением Института. Главной задачей работы отдела всегда было повышение эффективности диагностики и лечения воспалительных и аллергических заболеваний верхних дыхательных путей и доброкачественных новообразований ЛОР-органов. В отделе впервые в Украине была внедрена методика микроларингоскопии и эндоларингеальная микрохирургия. В период 1980-1985 гг. были проведены глубокие исследования и доказана высокая целесообразность терапии с применением вилозена, левамизола и других иммуномодулирующих средств. Впервые в СССР была предложена методика эффективного лечения больных с рецидивирующими производительными гаймороэтмоидитамы путем пересечения видиевого нерва. Сотрудниками отделения был впервые применен лазерный нож «Каштан» в хирургической практике на ЛОР-органах. Исследования по изучению использования пробиотических препаратов для лечения воспалительных заболеваний верхних дыхательных путей доказали их высокую эффективность и появление положительных изменений в системе иммунитета у таких пациентов.

Значительные успехи были достигнуты в изучении проблемы диагностики и лечения аллергических заболеваний верхних дыхательных путей. Этому способствовало создание в 2001 году, по инициативе Д.И. Заболотного, Центра аллергических заболеваний верхних дыхательных путей и уха. Одной из главных задач Центра за эти годы была клиническая апробация отечественных аллергенов, разработка технологии их применения, подготовка аллергологов и оториноларингологов Украины по вопросам применения аллергенов, распространение передового опыта, проведение отечественных и международных научных форумов с освещением вопросов внедрения отечественных аллергенов. Д.И. Заболотный возглавил группу ученых, которая впервые экспериментально доказала эффективность парентеральной и пероральной аллерген-специфической иммунотерапии. За эту работу в 2012 коллектив авторов во главе с академиком НАМН Украины Д.И. Заболотным был удостоен Государственной Премии Украины в области науки и техники.

К одному из главных направлений деятельности Института всегда относилось изучение этиологии и патогенеза различных видов нарушений слуховой и вестибулярной функции и разработка эффективных методов их диагностики, лечения и реабилитации. Значительный вклад в решение этой проблемы внесли известные ученые Е.Н. Харшак, профессора В.А. Гукович, В.Г. Базаров, Г.Э. Тимен, Т.В. Шидловская, Ю.А. Сушко, А.И. Раскладка и др.

С первых дней основания института была создана сурдоакустическая лаборатория. Значительные успехи в развитии слуховосстанавливающей хирургии вызвали необходимость создания аудиометрической службы во всех лечебных учреждениях Украины. В связи с этим Е.М. Харшак впервые в стране начал курсы подготовки по аудиологии и сурдологии, а также лаборантов-аудиометристов. Это способствовало созданию высококвалифицированной школы аудиологов в масштабах не только Украины, но и практически во всех республиках бывшего СССР. В дальнейшем в лаборатории, которую возглавил проф. В.Г. Базаров, было уделено много внимания вестибулометрическим обследованиям как в Институте, так и в Украине в целом. Был разработан и внедрен новый комплекс объективных методик исследования вестибулярного анализатора. Это широко известная в Украине и за ее пределами схема вестибулометрических исследований В.Г. Базарова. Были введены и усовершенствованны объективные электрофизиологические методы оценки функционального состояния слуховой и вестибулярной системы с использованием регистрации широкого спектра слуховых вызванных потенциалов и электронистагмографии. Это значительно повысило эффективность дифференциально-топической диагностики нарушений слухового и вестибулярного анализаторов. Проф. А. И. Розкладка - заведующий лабораторией с 2002 по 2014 гг. – глубоко вникал в проблемы психоакустики и интересовался надпороговой аудиометрией, в трактовке результатов которой был большой разнобой. Его успешно защищенная докторская диссертация "Надпороговая аудиометрия в диагностике нарушений слуховой системы человека" по-новому решала одну из самых сложных проблем сурдологии - топическую и дифференциальную диагностику нарушений слуха, открыла новое направление научных исследований в аудиологии, что способствовало улучшению медицинской и социальной реабилитации глухих и тугоухих людей. Благодаря научным разработкам лаборатории процедура слухопротезирования была значительно усовершенствована и стала выполняться на качественно новом, эффективном уровне. В лаборатории впервые в Украине была разработана и внедрена в практику программа эффективного кохлео-вестибулометрического обследования, отбора и тренировок кандидатов в космонавты. Все они проходили такое обследование, в том числе первый космонавт Украины - Л. Каденюк.

За комплексное исследование физиологии органа слуха и вестибулярного аппарата, разработку и внедрение в медицинскую практику методов и средств диагностики и реабилитации функций слуховой системы человека коллектив авторов, в который вошли сотрудники Института - Е.В. Гюллинг, В.Г. Базаров, В.Л. Лифанов, А.Н. Цисаренко, И.В. Марчук, Б.С. Мороз был удостоен Государственной премии Украинской ССР в области науки и техники 1987 года.

Отделение ЛОР-патологии детского возраста - единственный в Украине специализированное детское отоларингологический заведение где проводятся практически все хирургические вмешательства, при этом широко используются не только традиционные отоларингологические, но и нейрохирургические подходы. Руководитель центра чл.-корр. НАМН Украины Г.Э. Тимен стал основателем, на международном уровне, использования лазерных технологий в отоларингологии. В отделении впервые разработаны и внедрены новые методы диагностики и верификации интракохлеарных поражений при нейросенсорной тугоухости у детей, методики полимодальной передачи акустической информации таким больным.

В лаборатории профессиональных нарушений голоса и слуха, которую создала и возглавляет проф. Т.В. Шидловская, обоснованные и введены новые и оригинальные для мировой практики методы профилактики и успешного лечения сенсоневральной тугоухости шумового, радиационного, сосудистого, инфекционного и ототоксического генеза.

По замыслу проф. А.И. Коломийченко изначально Институт был основан как комплексное лечебное и научно-исследовательское учреждение, в котором работали не только отоларингологи, но и специалисты родственных профессий - патофизиологи, патоморфолога, иммунологи, биохимики, биофизики.

Благодаря глубоким научным разработкам, посвященным системе протеолиза, профессором К.М. Веремеенко, руководителем лаборатории биохимии, был создан фундамент клинической энзимологии, что позволило широко использовать в клинической оториноларингологии и смежных дисциплинах передовые достижения биохимии. При его непосредственном участии создано новое лечебное средство - «Биоадгезив», которое успешно применяется для бесшовного соединения тканей и ускорения заживления ран. Особую роль в расширении разработок по объединению учения о ферментах с проблемами биотехнологии сыграло создание в 1980 г. Республиканского центра медицинской энзимологии. К.М. Веремеенко стал основателем научной школы медицинской биохимии.

Сотрудниками лаборатории биофизики были разработаны и внедрены вместе с клиницистами ряд принципиально новых методов и приборов для использования низких температур и ультразвука как в отоларингологии, так и в других областях медицины. Было проведено широкое внедрение в клиническую практику метода ультразвуковой терапии больных хроническим тонзиллитом. Разработанные методы криоультразвуковой деструкции опухолей с использованием созданного «Криоультразвукового хирургического инструмента», защищенного авторскими патентами и внедренного в клиники страны. Комплексные физиологические и биофизические исследования позволили раскрыть особенности механизмов кодирования акустической информации на разных уровнях слуховой системы, создать физические и математические модели структур внутреннего уха. Это позволило разработать новые методы исследования слуха и устройства для тушения шумов и вибраций, что имело большое практическое значение.

Научные исследования, начатые профессором В.А.Тичининым и продолженные чл.-корр. НАМН Украины Е.В. Гюллингом были направлены на изучение роли иммунологических нарушений в генезе аллергических и воспалительных заболеваний ЛОР-органов и возможности их коррекции. Были заложены основы имунофармакологии - разработаны методы тестирования потенциальных иммуннокорректоров и создан ряд новых иммунномодуляторов. Эти исследования стали фундаментом для создания научной школы аллергологии и иммунологии в оториноларингологии, яркими представителями которой стали чл.-корр. НАМН Украины Е.В.Гюллинг, академик НАМН Украины Д.И. Заболотный, проф. А.Ф. Мельников, докт. мед. наук М.Б. Самбур.

Научные исследования, проводимые в Институте отоларингологии, соответствуют уровню современных мировых достижений. Свидетельством этого являются полученные сотрудниками Ленинская премия, две Государственные премии УССР, премия им. О.В.Палладина НАН Украины, два награждения Президента Украины «За заслуги», Почетные грамоты Кабинета Министров Украины; золотые, серебряные медали и дипломы ВДНХ СССР и Украины, Почетные грамоты коллегии МЗ Украины и Президиума АМН Украины, премии победителей Международных научных конкурсов.

С 2000 г. Институт отоларингологии подчинено Национальной Академии медицинских наук Украины.